Mapa Genoma Brasil - Medicina de precisão em oncologia e cardiologia no SUS
Através da parceria entre o Hospital BP – A Beneficência Portuguesa de São Paulo (BP), o Instituto do Coração do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São
Paulo (InCor/HCFMUSP) e a Secretaria de Ciência, Tecnologia e Inovação e do Complexo Econômico-Industrial da Saúde – SECTICS/MS, o presente projeto, “Mapa Genoma Brasil: saúde de precisão em oncologia e cardiologia no SUS” busca contribuir com o Programa Genomas Brasil em duas grandes áreas voltadas às Doenças Crônicas Não-Transmissíveis (DCNT): oncologia e cardiologia. Especificamente, o projeto pretende:
(1) contribuir para a implementação de estratégias de gestão populacional em câncer e doenças cardiovasculares, através da disponibilização de um banco de dados completo, contendo informações genotípicas e fenotípicas dos pacientes atendidos no SUS, o qual possibilitará identificar variantes genéticas associadas à suscetibilidade e ao agravamento dessas doenças e;
(2) qualificar profissionais de saúde em Medicina Genômica e de Precisão.
Para uma melhor compreensão, o projeto está estruturado em quatro (4) subprojetos (Subprojeto I – Oncologia; Subprojeto II – Cardiopatias Genéticas; Subprojeto III - Cardiologia Populacional; Subprojeto IV – Qualificação de profissionais da saúde em Saúde de Precisão). Cada um deles será composto por seus próprios objetivos específicos, metodologia, cronograma (entregas, atividades e marcos), organograma e custos associados.
As doenças crônicas não-transmissíveis (DCNT) corroboram para as elevadas taxas de morbidade e mortalidade, correspondendo a 70% dos óbitos mundiais e 72% no Brasil, atingindo principalmente os brasileiros com maior vulnerabilidade socioeconômica devido a maior exposição aos fatores de risco (Brasil, 2021). Dentre as DCNT as cardiovasculares são a de maior índice de mortalidade representando 30% e as oncológicas 17% dos óbitos no país. Estas patologias apresentam fatores de risco modificáveis e não modificáveis. Dentre os fatores modificáveis estão o tabagismo, o consumo excessivo de bebida alcoólica, sedentarismo e obesidade. Nos fatores não modificáveis estão a idade, maior prevalência a partir dos 50 anos, a história familiar e a predisposição genética (Brasil, 2021).
Os avanços tecnológicos associados ao desenvolvimento do Projeto Genoma Humano (PGH) estão viabilizando um maior entendimento sobre a predisposição genética nas DCNT. Com isso, é possível identificar dentre os indivíduos com DCNT aqueles que possuem alterações genéticas que os predispõem às doenças, o que permite a adoção de estratégias de prevenção primária, estimulando a menor a exposição dos indivíduos aos fatores de risco, e de prevenção secundária, com o precoce diagnóstico das patologias. Na última década, observou - se uma redução de 20% nos óbitos no país, o que pode ser atribuído à ampliação da atenção primária à saúde (APS), melhor atendimento e redução do tabagismo (Brasil, 2021).
No Brasil, a publicação do Projeto Genomas Brasil, proposta para o mapeamento genômico dos brasileiros, gerou a oportunidade de reconhecimento dos fatores genéticos no desenvolvimento das DCNT. Além disso, a união entre as informações do genoma com as informações clínicas, de história familiar e moleculares contribui para o estabelecimento da Saúde de Precisão, que é definida como “conjunto de técnicas que utilizam informações clínicas e biológicas do indivíduo ou de subgrupos da população para personalizar o cuidado em saúde.” (Brasil, 2021).
O projeto propõe a disponibilização de um banco de dados, contendo informações genotípicas e fenotípicas de pacientes atendidos no SUS estimulando a incorporação da genética, genômica e saúde precisão às linhas de cuidado em doenças oncológicas e cardiovasculares, através do desenvolvimento de processos, políticas públicas e protocolos clínicos difundidos por meio da qualificação e suporte aos profissionais da saúde dos grupos associados, aliado ao desenvolvimento tecnológico contribuindo com novas formas de diagnóstico e manejo clínico destas doenças. Com o conhecimento e avanços da Genética e Genômica, todos os níveis de atenção deverão ser articulados a esse modelo de atenção para garantir o acesso dos usuários do SUS de todo o território nacional.
A infraestrutura e os recursos necessários para realizar testes genéticos e moleculares avançados podem ser limitados, tornando o acesso a essas tecnologias desiguais, assim como a formação de profissionais de saúde capacitados para interpretar e aplicar os resultados de testes genéticos na prática clínica. É crucial investir na capacitação de médicos, geneticistas, e profissionais de saúde para garantir que a Medicina de Precisão seja adequadamente implementada. Se os profissionais e todos os níveis de atenção tiverem o conhecimento dos processos básicos do atendimento em genética e genômica, as unidades de Atenção Básica à Saúde (UBS) saberão acompanhar famílias que já realizaram testes moleculares em unidades de maior complexidade. Com ações educativas e a possibilidade do uso de estratégias como a Educação a Distância e um repositório on-line de conteúdo, a descentralização do atendimento voltado à Medicina Genômica poderá ser alcançada uma vez que todas essas ações promovem a qualificação de profissionais (Calzone et al., 2018). Além disso, o monitoramento preventivo de indivíduos com riscos maiores devido ao seu genótipo tem o potencial de reduzir custos para o sistema de saúde, especialmente através do diagnóstico de câncer em estadios iniciais (Tonkin et al., 2020). Em conclusão, a Medicina de Precisão oferece uma perspectiva promissora para a melhoria da saúde no SUS. No entanto, sua implementação requer um esforço coordenado para superar desafios técnicos, éticos e educacionais. Com o investimento adequado e a colaboração entre diversos setores, o SUS pode desempenhar um papel importante na promoção da Medicina de Precisão e na entrega de cuidados de saúde mais eficazes e personalizados aos cidadãos brasileiros.
Os subprojetos:
● Subprojeto I - Oncologia: propõe o mapeamento e registro do perfil clínico, epidemiológico, familiar e genômico de pacientes portadores de câncer de mama, próstata e colorretal atendidos pelos SUS. O perfil clínico e epidemiológico será traçado através do preenchimento de formulários padronizados, REDCap®, e o perfil familiar através da coleta de dados familiares e da construção de heredogramas, enquanto os dados genômicos serão obtidos através do WGS (Whole Genome Sequencing) germinativo e WES (Whole Exome Sequencing) somático tumoral, além da análise de custo-efetividade perante aplicação da saúde de precisão em oncologia no SUS.
• Subprojeto II – Cardiopatias Genéticas: propõe implementar estratégias com base genômica para aumentar a eficiência diagnóstica, estratificação de risco individual e familiar e do manejo das doenças cardiovasculares (cardiomiopatias, arritmias, dislipidemias, vasculopatias, valvopatias e doenças cardíacas congênitas), além da análise de custo-efetividade perante a aplicação da medicina de precisão em cardiologia no SUS.
● Subprojeto III - Cardiologia Populacional: propõe desenvolver um algoritmo de escore de risco poligênico para doenças cardiovasculares com dados genéticos, epidemiológicos, clínicos e laboratoriais da população brasileira da coorte ELSA Brasil, para estimar o efeito das variantes genéticas nos fenótipos cardiovasculares quantitativos e qualitativos (Genome Wide Association studies – GWAs).
● Subprojeto IV – Qualificação de profissionais da saúde em Saúde de Precisão: propõe desenvolver e implementar cursos de qualificação e treinamento em saúde de precisão e implementar um repositório de informações para a educação em saúde e educação permanente.
Subprojeto I - Oncologia: a população será composta por 1900 casos-índice entre homens e mulheres com idade igual ou superior a 18 anos, não aparentados entre si, com diagnóstico de câncer de mama, próstata ou colorretal, com anátomo patológico positivo, divididos em dois grupos:
Grupo 1 - serão incluídos 1700 casos índices com diagnóstico de câncer de mama, próstata ou colorretal, derivados de todos os centros participantes, para realização de WGS germinativo (sangue periférico/saliva).
Grupo 2 - serão incluídos 200 casos-índices para realização do exame WGS germinativo (sangue/saliva) pareado com WES somático (exoma do tecido tumoral). Esses casos serão coletados nos centros participantes localizados no estado de São Paulo, visando a maior estabilidade e qualidade das amostras a serem analisadas, possibilitando armazenamento futuro do material excedente dessas amostras em biobanco.
Para todos os 1900 casos-índices será realizado o mapeamento do perfil clínico, epidemiológico, familiar e genético por meio da estruturação de um banco de dados prospectivo. As variantes germinativas patogênicas (ou provavelmente patogênicas) identificadas em genes de predisposição hereditária ao câncer serão também rastreadas em até quatro (04), totalizando 1520, familiares de todos os casos-índices dos dois grupos de estudo, através de sequenciamento de Sanger (sequenciamento por eletroforese capilar). Será ofertado aconselhamento genético a todos os voluntários.
Objetivos Subprojeto I - Oncologia:
Estabelecer, validar e incorporar às linhas de cuidado e manejo clínico, estratégias de medicina de precisão individualizada doenças oncológicas.
Realizar aconselhamento genético pré e pós teste genético aos participantes e familiares, pautado na identificação de variáveis para câncer familiar, propiciando o estabelecimento do score de risco para doenças oncológicas.
Caracterizar o perfil clínico, epidemiológico, familiar, equidade e vulnerabilidade social, o rastreamento e frequência de variantes gênicas de pacientes oncológicos e seus familiares.
Estabelecer banco de dados com informações genéticas, clínicas, epidemiológicas da população estudada com doença oncológica que serão incorporados ao banco de dados do Programa Genomas Brasil.
Testar a custo-efetividade da implementação de diagnóstico molecular para doenças oncológicas em pacientes do SUS.
Subprojeto II – Cardiopatias Genéticas: a população será composta por 4000 indivíduos com diagnóstico clínico de uma das seguintes doenças: cardiomiopatias, arritmias, dislipidemias, vasculopatias, valvopatias e cardiopatias congênitas.
Para os casos-índices das cardiomiopatias, arritmias, dislipidemias, valvopatias e vasculopatias o método de escolha para investigação será o sequenciamento total do exoma (WES) por conta da relação de custo-benefício com o sequenciamento de painéis gênicos. A investigação será complementada pelas análises de MLPA para as dislipidemias e cardiopatias congênitas. O rastreamento familiar em cascata dos até 8000 familiares, quando necessário, será realizado por sequenciamento pelo método de Sanger. Nos casos de cardiopatias congênitas o sequenciamento de genoma completo (WGS) é o mais indicado para examinar as regiões alvos não codificadoras que poderão estar envolvidas. Será ofertado aconselhamento genético a todos os voluntários.
Objetivos do Subprojeto II – Cardiopatias Genéticas:
● Subprojeto III - Cardiologia Populacional: serão utilizados dados, feitas análises e sequenciamento de DNA (WGS) de até 11.700 indivíduos da população ELSA Brasil para estimar o efeito das variantes genéticas nos fenótipos cardiovasculares quantitativos e qualitativos (Genome Wide Association studies – GWAs). Estes dados servirão de base para estimativa dos escores de risco poligênico propostos por meio da ferramenta LDPred2.
A acurácia preditiva dos algoritmos será avaliada de maneira padrão utilizando outras amostras populacionais locais (e.g. Corações de Baependi e Epigen Pelotas) e europeias (e.g. UK biobank). As diferenças de prevalência de variáveis categóricas entre os decis de maior e menor risco genético serão avaliados por qui-quadrado. A razão de chances da ocorrência de doenças cardiovasculares no decil de maior risco versus de menor risco será avaliada por regressão logística multinomial.
Objetivos Subprojeto III - Cardiologia Populacional:
Subprojeto IV – Qualificação de profissionais da saúde em Saúde de Precisão: serão ofertadas 1200 vagas para profissionais da saúde (médico, enfermeiro, biomédico, farmacêutico, biólogo e agente comunitário) em 6 cursos de capacitação e 3 workshops relacionadas a temática do projeto e distribuídos ao longo do triênio 2024-2026:
Para as equipes dos centros parceiros que serão responsáveis pela inclusão de pacientes e familiares nos subprojetos I e II será oferecido o programa de treinamento (cursos 1 e 2) com o desenvolvimento de competências básicas e específicas. Essas competências possibilitarão o recrutamento de voluntários, coleta de amostras e orientação dos indivíduos e familiares a respeito do risco genético.
Objetivos Subprojeto IV – Qualificação de profissionais da saúde em Saúde de Precisão:
Principais Resultados:
Resultados por subprojeto
Mariana Beraldo da Costa Saad
Adhara Brandao Lima Vanhoz
Alecsander Alves da Silva
Andreuza Juliana Lopes
Bruna Lorena Alves Coelho
Bruna Palma da Matta
Carla Vanessa Quirino
Cristiane da Fonseca Amancio
Cristina da Silva Sábato
Daniel Dias Macario
Delciany Mylla de Aguiar Parente
Denise de Andrade Saavedra
Fernanda Adrielle Afonso
Fernando Alves Alencar de Moura
Gabriela Marinho da Silva
Gabriele Perroni dos Santos
Giselly Lopes Chagas Lourenço
Janaina Silva da Costa Rodrigues
Juliano Higino Alves de Souza
Karina Ramos Valino
Luanda Guimarães da Silva
Lucas Campacci
Maira Jaqueline de Souza
Matheus Martins Monteiro
Michele Soares Emílio Arauj
Natália Costa Braz
Samara Régia Oliveira
Talita Reimão Badesso Fonseca
Tamara Soares Guerra
Tayne Fernanda Lemos da Silva
Wellington dos Santos Queiroz
Ana Cristina Barbosa Dos Santos Reis
Angelica Nakagawa
Bianca Domit Wener Linnenkamp
Bruno de Oliveira Stephan
Elisangela Aparecida da Silva
Emanuelle Leonilia Marques
Fernanda Almeida de Andrade
Fernando Pacheco Nobre Rossi
Gardênia da Silva Lobo Oishi
Giovanna Napolitano
Heracles Ferreira Dias Coelho
Ingrid Martinez Nakamuta
Jéssica Fausto
Kelvin Henrique Vilalva
Layara Fernanda Vicente Pereira Lipari
Lucas Vieira Lacerda Pires
Luciana Rodrigues Carvalho Barros
Marco Antonio Gutierrez
Mariana Lombardi Peres de Carvalho
Marjorie Hayashida Mizuta
Mateus de Oliveira Torres
Matheus Hideo Faria Higa
Nara Alves Buriti
Natalia Quintella Sangiorgi Olivetti
Natalya Pereira
Paulo Thiago de Souza Santos
Renata Carmona de Souza
Renata Sandoval
Renato Oliveira
Silas Ramos Furquim
Vanessa Monteleone
Vitória Pelegrino do Val
Dr. Aguinaldo F. Freitas Jr.
Dra. Cristina de Deus Anjos Tavares
Dr. Delvone Freire Gel Almeida
Dra. Edileide de Barros Correia
Dr. Edilmar de Moura
Dr. Hélio Lima Brito Jr.
Dra. Hilka Flávia Barra do Espírito Santo Alves Pereira
Dr. Horacio Tamada
Dr. João M. Ferreira
Dr. José Fernando Bastos Moura
Dra. Juliana Ramos Chaves
Dra. Lídia Zytynski Moura
Dr. Luís Henrique Wolff Gowdak
Dr. Paulo Carrara de Castro
Dra. Silvia Marinho Martins Alves
Dra. Veridiana Andrade
Dra. Letícia Elizabeth Augustin Czeczko Rutz
Secretaria de Ciência, Tecnologia e Inovação e do Complexo Econômico-Industrial da Saúde – SECTICS
Dr. Benedito Mauro Rossi
Dra. Edenir Inez Palmero
Dra. Erika Maria Monteiro Santos
Dr. Fábio de Oliveira Ferreira
Dra. Gisele Medeiros Bastos
Dr. Gustavo Cardoso Guimarães
Dr. José Eduardo Krieger
Dra. Natália Campacci
Dr. Pablo Domingos Rodrigues De Nicola
Dra. Rozana Cicconeli
