Resumo

Cerca de 9 mil enfermidades distintas compõem o grupo de doenças raras conhecidas. O diagnóstico definitivo é desafiador, levando sofrimento aos pacientes e longas buscas por atendimento, gerando um importante impacto no sistema de saúde como um todo, além do aumento de morbidade e mortalidade decorrentes dessas doenças.

O Sequenciamento de Genoma Completo (SGC) tem potencial de substituir vários outros exames diagnósticos, levando não só à diminuição do custo total com a investigação genética, mas também a um menor tempo total de jornada diagnóstica. Ainda assim, o Brasil não encontra sua população representada em estudos de outros países, ou iniciativas internacionais. 

Pensando em desenvolver um estudo que englobasse o país como um todo, incluindo suas particularidades regionais, e abrangesse uma maior diversidade genética, o Ministério da Saúde (MS) propôs a criação do projeto Genomas Brasil, uma grande iniciativa que pretende sequenciar o DNA de 100 mil brasileiros, de todas as regiões, entre coortes de pacientes com doenças raras e coortes populacionais. Para contribuir com o sucesso do projeto e aumentar a capacidade diagnóstica, foi desenvolvido o projeto Genomas Raros, que pretende fazer o sequenciamento genômico completo  de indivíduos com doenças raras, incluindo as síndromes de risco hereditário de câncer. O projeto deve também avaliar, no futuro, a custo-efetividade dessa ferramenta em vários cenários para uso no SUS.

 

Introdução

Serão sequenciados cerca de 8 mil genomas durante o triênio 2021-2023 no Hospital Israelita Albert Einstein, em São Paulo. O propósito é avaliar geneticamente as diversas coortes de doenças raras e os pacientes com potencial risco hereditário de câncer. Os familiares de indivíduos que apresentarem algum tipo de alteração estabelecida pelo SGC  também receberão aconselhamento genético. 

Outro objetivo é a atualização anual dos Protocolos Operacionais Padrão (POP) de coleta de informações clínicas, coleta e transporte de amostras biológicas, processamento de amostras biológicas e sequenciamento de nova geração, tratamento dos dados do sequenciamento e melhores práticas em bioinformática, análise e classificação de variantes genéticas e formulação de laudo. 

O projeto também irá catalogar e disponibilizar um banco de dados fenotípicos dos indivíduos que participarem do estudo, além das variações genéticas que causam as doenças. Ao final, serão publicados artigos científicos com os resultados.

A uniformização de protocolos e a base de dados que serão incorporadas ao SUS ao final do programa serão importantes para implementar novos projetos de medicina de precisão, que trarão maior custo-efetividade e melhor qualidade de vida aos brasileiros atendidos pelo SUS. Outras instituições e grupos de pesquisa poderão desenvolver estudos adicionais utilizando o banco de dados criado e disponibilizado ao MS.

Além disso, o projeto tem potencial para redução dos custos de investigação e aumento das taxas de diagnóstico, tratamento e prevenção, melhorando o acesso aos serviços de saúde e à informação, além de contribuir com a redução da morbimortalidade causada por essas doenças. Já o envolvimento de profissionais do SUS de diversos estados criará uma massa crítica de indivíduos treinados em genética, facilitando a futura adoção dessas tecnologias no cuidado à saúde.

 


Métodos

Foram recrutados indivíduos de 18 centros públicos de atendimento a pacientes com doenças raras e com câncer, localizados em quase todas as regiões do país. O  Einstein receberá as amostras coletadas para a extração do DNA e RNA. 

Após a conferência dos dados clínicos, o DNA será enviado para o preparo de biblioteca e, em seguida, sequenciado no Einstein. Com a obtenção dos dados clínicos e genômicos, as amostras serão analisadas em busca de variantes que definem o diagnóstico dos indivíduos investigados. Estes resultados serão informados, por laudos, aos centros participantes, que devem repassar as informações aos pacientes.

Além do resultado imediato de diagnóstico, os centros terão acesso aos dados brutos de seus pacientes e poderão continuar a investigação das causas genéticas, buscando alterações genômicas em diferentes contextos.

 


Resultados

Principais Resultados:

  • 8336 pacientes recrutados;
  • 7520 pacientes sequenciados;
  • 1000 transcriptomas;
  • 5341 laudos liberados;
  • 21 centros ativos e 4 em submissão local;
  • Envios ao ClinVar: 1406 genes únicos; 1100 fenótipos únicos; 3137 pares de variantes/fenótipos e 3118 variantes únicas;
  • I Workshop Online do Projeto Genomas Raros (400 inscritos);
  • II Workshop Online do Projeto Genomas Raros (551 inscritos);
  • III Workshop Online do Projeto Genomas Raros (493 inscritos);
  • I Workshop sobre Gestão e Compartilhamento de Dados Genômicos;
  • Entregues 4 estudos:
  • Microcusteio do sequenciamento completo do genoma e sequenciamento completo do exoma;
  • Revisão sistemática da literatura da custo-efetividade do exame sequenciamento completo do genoma em comparação ao sequenciamento completo de exoma de pacientes com transtornos do neurodesenvolvimento;
  • Análise de custo-efetividade para pacientes com transtorno do neurodesenvolvimento com uso dos dados do projeto e da literatura;
  • Painel Delphi para avaliação da utilidade clínica e mudanças no manejo clínico/conduta do tratamento de recém-nascidos e lactentes em estado crítico e internadas em UTI com o diagnóstico dado pelo Sequenciamento de genoma completo (parceria com a Consultoria Cerner/Oracle);
  • Atualização dos Critérios de Inclusão: vascular; câncer hereditário pediátrico e pacientes críticos;
  • Atualização do Manual, treinamento para centros colaboradores e início do recrutamento do centro no Pará;
  • Pesquisa de Mutação Específica por método ortogonal: 162 exames;
  • Criação da rede de interpretação clínica – treinamento em análise do genoma (16 centros participantes e Ministério da Saúde; 59 inscritos);
  • 18 trabalhos científicos (artigos, pôsteres e apresentações em congresso) - centro coordenador, sendo os de maior destaque:
  • https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.09.09.22279721v1
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9108541/#:~:text=The%20Brazilian%20Rare%20Genomes%20Project%20envisions%20further%20the%20implementation%20of,diagnostic%20capacity%20for%20rare%20disorders
  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36147510/
  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36537231/
  • https://www.nature.com/articles/s41431-022-01098-7
  • 57 trabalhos científicos - centros participantes.

  • Equipe

    • Hospital Israelita Albert Einstein

      Liderança

      João Bosco Oliveira Filho - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes


      Equipe

      Allysson Allan de Farias - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Ana Flávia Martinho Ferreira - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Ana Paula de Andrade Oliveira - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Anne Caroline Barbosa Teixeira- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Antonio Victor Campos Coelho- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Caio Robledo D' Angioli Costa Quaio- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Carolina Araujo Moreno- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Carolina Dias Carlos- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Diego Delgado Colombo de Oliveira - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Edson Alves de Souza - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Eduardo Perrone- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Felipe Camilo Val - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Gabriela Borges Cherulli Colichio- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Gabriela Pereira Campilongo - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Joana Rosa Marques Prota- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      José Ricardo Magliocco Ceroni- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Karla de Oliveira Pelegrino- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Kelin Chen- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Livia Maria Silva Moura- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Luiza do Amaral Virmond - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Marcel Pinheiro Caraciolo - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Marco Antonio de Paulo Junior - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Marina Cadena da Matta- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Marina de França Basto Silva- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Matheus Martinelli Lima - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Murilo Castro Cervato - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Rafael Muniz Guedes- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes 

      Rafael Sales de Albuquerque - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Renata Yoshiko Yamada - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Renata Moldenhauer MinIllo - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Rodrigo Barreiro - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Rodrigo de Souza Reis - Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP

      Susam Kathleen Camargo- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Tatiana Ferreira de Almeida- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes

      Vivian Pedigone Cintra- Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes


      Colaboração
      Cristóvão Luis Pitangueiras Mangueira – Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP - Lattes  
      Área Técnica
      Coordenação-Geral de Atenção Especializada, do Departamento de Atenção Especializada e Temática, da Secretaria de Atenção à Saúde (CGAE/DAET/SAS)

    Indicadores

    224
    Quantidade de profissionais
    envolvidos em pesquisa
    15992
    Quantidade de participantes
    envolvidos na pesquisa

    Instituições

    • São Paulo

      hospital das clinicas da fmusp
      faculdade de medicina do abc
      hosp mun gilson de cassia marques de carvalho
      nucleo tecnico cientifico telessaude brasil redes unifesp
    • Recife

      hospital das clinicas faepa ribeirao preto
      hospital de cancer de pernambuco
      hospital das clinicas
    • Porto Alegre

      hospital de clinicas
    • Pindobaçu

      hospital professor edgar santos
    • Curitiba

      hospital infantil pequeno principe
    • Campinas

      hospital das clinicas da unicamp de campinas
    • Belo Horizonte

      hospital infantil joao paulo ii
    • Natal

      huol hospital universitario onofre lopes
    • Brasília

      hospital materno infantil de brasilia hmib
      hospital de apoio de brasilia hab
    • Anápolis

      apae anapolis
    • Salvador

      apae salvador
    • Fortaleza

      hias hospital infantil albert sabin

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