Resumo

Cerca de 9 mil enfermidades distintas compõem o grupo de doenças raras conhecidas. O diagnóstico definitivo é desafiador, levando sofrimento aos pacientes e longas buscas por atendimento, gerando um importante impacto no sistema de saúde como um todo, além do aumento de morbidade e mortalidade decorrentes dessas doenças.

O Sequenciamento de Genoma Completo (SGC) tem potencial de substituir vários outros exames diagnósticos, levando não só à diminuição do custo total com a investigação genética, mas também a um menor tempo total de jornada diagnóstica. Ainda assim, o Brasil não encontra sua população representada em estudos de outros países, ou iniciativas internacionais. 

Pensando em desenvolver um estudo que englobasse o país como um todo, incluindo suas particularidades regionais, e abrangesse uma maior diversidade genética, o Ministério da Saúde (MS) propôs a criação do projeto Genomas Brasil, uma grande iniciativa que pretende sequenciar o DNA de 100 mil brasileiros, de todas as regiões, entre coortes de pacientes com doenças raras e coortes populacionais. Para contribuir com o sucesso do projeto e aumentar a capacidade diagnóstica, foi desenvolvido o projeto Genomas Raros, que pretende fazer o sequenciamento genômico completo  de indivíduos com doenças raras, incluindo as síndromes de risco hereditário de câncer. O projeto deve também avaliar, no futuro, a custo-efetividade dessa ferramenta em vários cenários para uso no SUS.

 

Introdução

Serão sequenciados cerca de 8 mil genomas durante o triênio 2021-2023 no Hospital Israelita Albert Einstein, em São Paulo. O propósito é avaliar geneticamente as diversas coortes de doenças raras e os pacientes com potencial risco hereditário de câncer. Os familiares de indivíduos que apresentarem algum tipo de alteração estabelecida pelo SGC  também receberão aconselhamento genético. 

Outro objetivo é a atualização anual dos Protocolos Operacionais Padrão (POP) de coleta de informações clínicas, coleta e transporte de amostras biológicas, processamento de amostras biológicas e sequenciamento de nova geração, tratamento dos dados do sequenciamento e melhores práticas em bioinformática, análise e classificação de variantes genéticas e formulação de laudo. 

O projeto também irá catalogar e disponibilizar um banco de dados fenotípicos dos indivíduos que participarem do estudo, além das variações genéticas que causam as doenças. Ao final, serão publicados artigos científicos com os resultados.

A uniformização de protocolos e a base de dados que serão incorporadas ao SUS ao final do programa serão importantes para implementar novos projetos de medicina de precisão, que trarão maior custo-efetividade e melhor qualidade de vida aos brasileiros atendidos pelo SUS. Outras instituições e grupos de pesquisa poderão desenvolver estudos adicionais utilizando o banco de dados criado e disponibilizado ao MS.

Além disso, o projeto tem potencial para redução dos custos de investigação e aumento das taxas de diagnóstico, tratamento e prevenção, melhorando o acesso aos serviços de saúde e à informação, além de contribuir com a redução da morbimortalidade causada por essas doenças. Já o envolvimento de profissionais do SUS de diversos estados criará uma massa crítica de indivíduos treinados em genética, facilitando a futura adoção dessas tecnologias no cuidado à saúde.

 


Métodos

Foram recrutados indivíduos de 18 centros públicos de atendimento a pacientes com doenças raras e com câncer, localizados em quase todas as regiões do país. O  Einstein receberá as amostras coletadas para a extração do DNA e RNA. 

Após a conferência dos dados clínicos, o DNA será enviado para o preparo de biblioteca e, em seguida, sequenciado no Einstein. Com a obtenção dos dados clínicos e genômicos, as amostras serão analisadas em busca de variantes que definem o diagnóstico dos indivíduos investigados. Estes resultados serão informados, por laudos, aos centros participantes, que devem repassar as informações aos pacientes.

Além do resultado imediato de diagnóstico, os centros terão acesso aos dados brutos de seus pacientes e poderão continuar a investigação das causas genéticas, buscando alterações genômicas em diferentes contextos.

 


Resultados

Principais Resultados:

  • 8336 pacientes recrutados;
  • 7928 pacientes sequenciados;
  • 1000 transcriptomas;
  • 4342 laudos liberados;
  • 21 centros ativos e 4 em submissão local;
  • Envios ao ClinVar: 1406 genes únicos; 1100 fenótipos únicos; 3137 pares de variantes/fenótipos e 3118 variantes únicas;
  • I Workshop Online do Projeto Genomas Raros (400 inscritos);
  • II Workshop Online do Projeto Genomas Raros (551 inscritos);
  • III Workshop Online do Projeto Genomas Raros (493 inscritos);
  • I Workshop sobre Gestão e Compartilhamento de Dados Genômicos;
  • Entregues 4 estudos:
  • Microcusteio do sequenciamento completo do genoma e sequenciamento completo do exoma;
  • Revisão sistemática da literatura da custo-efetividade do exame sequenciamento completo do genoma em comparação ao sequenciamento completo de exoma de pacientes com transtornos do neurodesenvolvimento;
  • Análise de custo-efetividade para pacientes com transtorno do neurodesenvolvimento com uso dos dados do projeto e da literatura;
  • Painel Delphi para avaliação da utilidade clínica e mudanças no manejo clínico/conduta do tratamento de recém-nascidos e lactentes em estado crítico e internadas em UTI com o diagnóstico dado pelo Sequenciamento de genoma completo (parceria com a Consultoria Cerner/Oracle);
  • Atualização dos Critérios de Inclusão: vascular; câncer hereditário pediátrico e pacientes críticos;
  • Atualização do Manual, treinamento para centros colaboradores e início do recrutamento do centro no Pará;
  • Pesquisa de Mutação Específica por método ortogonal: 162 exames;
  • Criação da rede de interpretação clínica – treinamento em análise do genoma (16 centros participantes e Ministério da Saúde; 59 inscritos);
  • 18 trabalhos científicos (artigos, pôsteres e apresentações em congresso) - centro coordenador, sendo os de maior destaque:
  • https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.09.09.22279721v1
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9108541/#:~:text=The%20Brazilian%20Rare%20Genomes%20Project%20envisions%20further%20the%20implementation%20of,diagnostic%20capacity%20for%20rare%20disorders
  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36147510/
  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36537231/
  • https://www.nature.com/articles/s41431-022-01098-7
  • 57 trabalhos científicos - centros participantes.

  • Equipe

    • Einstein Hospital Israelita





    Indicadores

    224
    Quantidade de profissionais
    envolvidos em pesquisa
    15992
    Quantidade de participantes
    envolvidos na pesquisa

    Abrangência

    • Bahia

      • Pindobaçu

        hospital professor edgar santos
      • Salvador

        apae salvador
    • Ceará

      • Fortaleza

        hias hospital infantil albert sabin
    • Distrito Federal

      • Brasília

        hospital de apoio de brasilia hab
        hospital materno infantil de brasilia hmib
    • Goiás

      • Anápolis

        apae anapolis
    • Minas Gerais

      • Belo Horizonte

        hospital infantil joao paulo ii
    • Paraná

      • Curitiba

        hospital infantil pequeno principe
    • Pernambuco

      • Recife

        hospital das clinicas
        hospital das clinicas faepa ribeirao preto
        hospital de cancer de pernambuco
    • Rio Grande do Norte

      • Natal

        huol hospital universitario onofre lopes
    • Rio Grande do Sul

      • Porto Alegre

        hospital de clinicas
    • São Paulo

      • Campinas

        hospital das clinicas da unicamp de campinas
      • São Paulo

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        nucleo tecnico cientifico telessaude brasil redes unifesp

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